当企业认为其商业秘密受到侵害，无论是否造成了实际的损失，都可以向工商行政管理机关申请查处侵权行为。企业因损害赔偿问题也可向工商行政管理机关提出调解请求，工商行政管理机关可以进行调解。
在向工商部门申请查处侵犯商业秘密的行为时，企业需要注意以下问题。
1.企业需要承担一定的举证责任
虽然工商部门立案之后会主动采取现场检查、调查询问、鉴定等手段进行调查取证，但是这并不是说工商部门会大包大揽所有的举证工作，因为商业秘密是企业的一种私权，如果企业没有举报、投诉和举证，工商部门很难发现，也无从查起。
如果权利人认为其商业秘密受到侵害，向工商行政管理机关申请查处侵权行为时，应当提供商业秘密及侵权行为存在的有关证据。根据规定，权利人能证明被申请人所使用的信息与自己的商业秘密具有一致性或者相同性，同时能证明被申请人有获取其商业秘密的条件，而被申请人不能提供或者拒不提供其所使用的信息是合法获得或者使用的证据的，工商行政管理机关可以根据有关证据，认定被申请人有侵权行为。
